Logo Pusat Sejarah merupakan lambang rasmi Jabatan seperti kebenaran Memorandum Kementerian Kebudayaan Belia & Sukan, Bilangan : (27) KKBS 1.5 bertarikh 3 Mac 1984.

Logo dan ukiran-ukiran dalam lingkungan bulat dipadankan dari Cap Mohor yang digunakan oleh Kebawah Duli Yang Maha Mulia Paduka Seri Baginda Sultan Omar Ali Saifuddin II (1828-1852). Warna-warna yang digunakan dalam logo ini diambil dari sempena warna bendera Negara Brunei Darussalam iaitu kuning, putih dan hitam.

Ukiran bunga air mulih yang terdapat dalam logo ini mengandungi pengertian orang Brunei sentiasa berlemah lembut. Bunga keramunting yang disifatkan lambang yang menggambarkan sesuatu yang memuaskan hati.